Chiostro superiore
Attraverso la sacrestia superiore si accede dunque alla parte superiore del chiostro che immette al piano nobile dei locali della rettorìa ove è concentrato il nucleo principale del museo. Oltre ad offrire una splendida visuale del complesso del santuario, il chiostro da un tono conventuale alla struttura sebbene sia stato realizzato solamente negli anni '30 a completamento dei lavori di ristrutturazione della casa del rettore. L'area, di circa 150 mq di ampiezza, consente un camminamento circolare terrazzato che consente di ammirare anche il Cortile del Pozzo ove è conservato un pregevole esempio di pozzo rinascimentale a forma di capitello con stemmi araldici.